분자 상호 실험: CLIP 자외선 접착제 면역 침전

1. 기술 소개

CLIP(Cross-linking immunoprecipitation)는交联면역 공침전) 결합을 통해UV 연결면역과 함께 침전되는 방법으로 단백질과 RNA 상호작용의 결합 위치를 분석한다.

2. 기술원리

CLIP 기술은 자외선을 이용해 세포 내 RNA와 RNA결합단백질(RBP)을 공가교련시킨 뒤 면역침전의 방법으로 특정 RBP와 결합한 RNA 조각을 풍부하게 모은 뒤 역전록과 높은 통량 서열 분석 등의 절차를 거쳐 RBP의 체내 RNA결합 비트와 결합 서열 정보를 얻는다.

3. 응용장면

1.단백질-RNA 상호작용 연구: 체내에서 특정 단백질의 RNA 결합 위치와 결합 서열을 확정하여 전사 후 단백질의 조절 작용 메커니즘을 밝혀낸다.

2. 질병 관련 연구: 비교적 정상적이고 질병 상태에서 RBP의 RNA 결합 상황을 통해 질병의 발생, 발전과 관련된 RNA 결합 사건과 조절 네트워크를 발견한다.

3.약물 개발: 약물 개발에 새로운 표적과 작용 메커니즘을 제공하여 특정 RNA 결합 단백질 또는 그 조절 된 RNA 분자에 대한 약물 개발을 돕습니다.

4. 생물정보학 분석: CLIP-seq 데이터에 대한 생물정보학 분석을 통해 RNA 결합 단백질의 결합 위치와 결합 모델을 예측하고 RNA 조정 네트워크 등을 구축한다.

4. 기술우세

1.체내 제자리 검사: 생체세포 내에서 단백질과 RNA의 상호작용을 포획하여 체내의 생리상태를 진실하게 반영할 수 있다.

2. 높은 특이성과 엄격한 순화: 특이성 항체 또는 라벨 순화 접합 복합체를 통해 비특이성이 결합된 RNA와 단백질을 효과적으로 제거하고 결과의 신뢰도를 높일 수 있다.

3.결합 고통량 시퀀싱: 고통량 시퀀싱 기술과 결합하여 전체 게놈 범위 내에서 RBP의 RNA 결합 비트와 결합 시퀀스를 감정하여 풍부한 정보를 얻을 수 있다.

5. 견본 유형

신선한 세포 (밀착 세포 / 부상 세포), 자외선 교련 후 세포 샘플.

6. 견본 수요

세포 샘플: 약 1 × 10 ^ 7 개 (10 cm 접시 1 개 또는 원심관에 부유 세포 형태로 저장 또는 T75 병 1 개);

교련 세포 샘플: 254 nm, 150 mJ/cm² 표준 UV 교련 처리 세포.

7. 견본 준비 & 운송

살아있는 세포 샘플: 거리가 가까운 것은 그릇/T75병/원심관 내에 키울 수 있는 신선한 세포 샘플을 상온 택배 (늦어도 다음날 도착) 로 운송할 수 있으며, 본 시내는 플래시 또는 직접 배달할 수 있다;

교련 후 세포 샘플: -80 ℃ 냉동 건조 얼음 운송.

8. 공급해야 할 시약

검사용 ChIP급 항체.

9. 실험주기

1~2주 (시퀀스 제외)

10. 기타

후속 테스트RT PCR을 선택할 경우 후속 테스트의 비트를 제공해야 합니다.