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RNA 바인딩 DNA 및 단백질 상호 작용: CHIRP
면역 공침전 실험(Chromatin Isolation by RNA Purification, CHIRP) - 체내에서 RNA와 바인딩된 DNA와 단백질의 상호작용을 검사하는 방법으로 IncRNAcircRNA, 단백질 및 DNA의 상호작용관계를 동시에 분석할 수 있다.
CHIRP 실험의 의미
IncRNA는 단백질, DNA 및 RNA와 상호 작용하여 다양한 기능을 구현 할 수 있으며 CHIRP는 IncRNA와 상호 작용하는 DNA 단백질의 기능과 작용 메커니즘을 연구 할 수 있으며 관련 과학 연구 작업의 강력한 도구입니다.IncRNA의 연구는 표관유전조절 등 생명활동에서 중요한 역할을 발휘하는데 CHIRP는 연구이다
IncRNA의 중요한 기술 수단은 전체 게놈 범위 내에서 RNA와 염색질의 상호작용을 감정하고 이를 정성, 정량 및 위치 분석할 수 있다.
CHIRP 실험원리
CHIRP(Chromatin Isolation by RNA Purification)는 바이오매스를 결합한 핵산 프로브를 통해 목표 RNA를 끌어내리면 그와 함께 작용하는 DNA 염색체 조각(DNA와 단백질 복합체)이 흡착돼 qRT-PCR. WB. 서열 분석과 질량 분석 등을 통해 RNA. DNA와 단백질을 검출할 수 있다.
CHIRP의 실험 프로세스
① 프로브 설계: 반의적 뉴클레오티드 프로브 설계:
② 세포 배양;
③ 세포를 분쇄한다:
④ 바이오매스 마커의 DNA 탐지기와 RNA 교잡;
⑤CHIRP;
⑥ RNA, DNA 및 핵산 결합 단백질 추출; .
⑦ 분석 검사.,
결과 표시
실험 완료 주기 및 제공 기준
1. 실험 주기: 1~3개월
2. 제공 기준: CHIRP 검증 결과 보고서, 분석 보고서, 실험 보고서(시약, 소모품, 실험 절차), 원시 데이터 등
고객과 실험에 필요한 정보
1. 목적 유전자와 단백질 정보.
2. 샘플 유형 및 종속
3. 생신 분석 필요 여부
참고문헌
[1]lyer S, Modali S D, Agarwal S K. 긴 비 코딩 RNA MEG3은 기능적 胰腺 신경 내분泌 종양 세포에서 종양 신호를 발생시키는 에피지네틱 결정자입니다.분자 및 세포 생물학, 2017: MCB.00278-17.
[2] Chu C, Chang H Y.RNA 정화로 크로마틴 분리를 사용하여 RNA-크로마틴 상호 작용을 이해하기 (ChIRP).[J].분자 생물학의 방법, 2016, 1480.
[3] ZhuJJ, FuHJ, Wu Y G, et al. IncRNA의 기능과 IncRNA-단백질 상호 작용에 대한 접근법 [J].과학
중국 생명 과학, 2013, 56 (10) : 876-885.
부분 실험 대행 서비스
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