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illumina 2세대 서열 분석기

협상 가능업데이트05/07
모델
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제품 카테고리
원산지 Place of Origin

개요

illumina 2세대 시퀀서 측정기 MiSeq 시스템은 다양한 시퀀싱 애플리케이션을 통해 연구에 편의를 제공할 수 있습니다.듀얼 엔드 read를 자동으로 생성하여 실행할 때마다 최대 15Gb를 생산하며, 각 read는 600개 이상의 염기 시퀀싱 데이터를 제공합니다.그가 사용하는 문고제조시약함은 이미 여러가지 응용에 최적화되였는데 여기에는 표적유전자서렬분석, 소형게놈서렬분석, 증폭자서렬분석, 16S 매크로게놈학 등이 포함된다.

제품 정보

인메나회사 출시의MiSeq는 확장, 시퀀싱 및 데이터 분석을 단일 기기에 통합한 새로운 시퀀싱 기기로, 한 번에 1Gb 이상의 데이터를 생성하고 2제곱피트 면적을 차지합니다.MiSeq의 프로세스와 정확성은 광범위한 응용에 적합한 빠르고 경제적인 유전체 분석을위한 이상적인 플랫폼이되었습니다.이와 동시에 Illumina는 이미 FDA에 의해 대량으로 구매되였고 곧 FDA의 인증을 통과하게 되는데 12년 10월에 MiSeq시스템의 서렬분석통량은 이미 8G좌우로 승격되였다.업그레이드는 두 가지 측면에서 이루어집니다. 하나는 cluster 밀도의 증가입니다. 업그레이드 후 cluster 밀도는 15-17million으로 증가하고 pair-end가 읽는 reads 수는 30-34million으로 증가합니다.다른 한편으로는 서열 읽기 길이를 측정하여 통량을 향상시키고, 서열 읽기 길이가 2 * 300bp에 달하며, 동시에 서열 측정 속도도 향상되었다.현재 Broad 연구원은 기존 시약을 이용하여 단일 시퀀싱 300bp 읽기 길이를 구현했으며, Illumina는 현재 내부 시퀀싱 2 * 400bp의 pair-end 시퀀싱을 완료했다.그리고 이것들은 모두 고품질 데이터 결과를 보장하는 전제하에 완성된 것이다.


MiSeq 성능 매개 변수


Illumina MiSeq 시퀀싱 시간 및 데이터 양


읽기 길이 (bp) 시간 총 데이터 양 Q30은
1×36 ~ 4시간 540-610 Mb ﹥90%
2×25 ~ 5.5 시간 750-850 Mb ﹥90%
2×100 ~16.5시간 3.0-3.4 Gb ﹥85%
2×150 ~ 24시간 4.5-5.1 Gb ﹥80%
2×250 ~ 39 시간 7.5-8.5 Gb ﹥70%



Illumina MiSeq 읽기 페어


실행 유형 필터링을 통한 읽기 (백만)
업그레이드 전 업그레이드 후
단일 읽기 5-7 M 15-17 M
끝 쌍 읽기 10-14 M 30-34 M


워크플로우


illumina 2세대 서열 분석기MiSeq 4큰 특성

1. 비교적 짧은 실험주기: 견본제조로부터 8시간이 걸리면 100M이 넘는 고품질서렬분석결과를 얻을수 있다.

2. 편리한 샘플 제조 프로세스: 50ngDNA 템플릿이 필요하며, 2시간의 자동화 작업으로 모든 샘플 제조 작업을 완료할 수 있습니다.

3. 시퀀싱 원리: MiSeq는 GA와 HiSeq 플랫폼의 합성을 계속하면서 시퀀싱의 화학 원리를 측정한다.

4. 완전한 통합 기능: MiSeq는 클러스터 생성, 양방향 시퀀싱 및 데이터 분석 작업을 독립적으로 완료할 수 있으며, 경비와 실험실 공간이 더 이상 NGS 연구의 장애가 되지 않도록 한다.


illumina 2세대 서열 분석기MiSeq 적용 범위

1. 전사 그룹 시퀀스

파이센노 MiSeq 시퀀싱 플랫폼은 게놈 시퀀싱된 종의 전사 그룹 분석 플랫폼입니다.회사 기술팀은 현재 제브라피시를 포함한 다양한 식물, 동물의 전사팀 서열 분석 및 분석을 마쳤다.


2. 매크로 게놈 16S rDNA 단일 V 영역 시퀀싱

16s rDNA의 단일 V존 (V3 \ \ V4) 에 대해 높은 통량 서열을 측정하여 세균군과 고생균군을 감정한다.파이센노의 기술 팀은 Illumina MiSeq를 사용하여 16S rDNA V4 영역을 시퀀싱하고 Roche 454 FLX+ 시퀀싱 16S rDNA V1~V3 영역을 결합하여 닭의 장 환경 박테리아를 성공적으로 감정했습니다.


3. Small RNA 시퀀싱

1 * 35bp의 읽기 길이는 작은 RNA의 시퀀스 길이와 함께 빠르고 민감도가 높습니다.파이센노의 기술팀은 현재 거위의 작은 RNA 시퀀싱과 다양한 약초의 작은 RNA 시퀀싱을 완료했다.


4. 재측정: 전체 게놈 재측정, 간소화 게놈 시퀀싱, 외현자 시퀀싱을 포함한다.

Illumina MiSeq는 미생물 게놈의 시퀀싱을 재측정하는 데 매우 적합하며, 실행할 때마다 미생물 게놈 시퀀싱을 완료할 수 있습니다.2011년 12월 27일, 파이센노의 기술팀은 MiSeq의 한 번의 실행을 이용하여 유산균 (Lactobacillus casei Zhang 및 Lactobacillus casei P8) 의 재측정을 동시에 완료했다. 게놈 커버리지는 각각 404배와 213배로 참조 시퀀스에 비해 게놈은 전체 커버리지를 실현하고 동시에 다양한 구조 변이를 검출했다. 또한 입자, 모든 누락, SNP 삽입, 모든 누락이 검출되었다.


데이터 프레젠테이션

* 위의 제품 설명 및 데이터는 Illumina에서 파생되었으며 Illumina에서만 참조할 수 있습니다.기준.