환상 RNA 칩 맞춤형 검사 서비스 제공 표준

환상 RNA 칩 맞춤형 검사 서비스

실험 기술 소개: 환상 RNA(ircRNA) 는 전통적인 선형 RNA와 구별되는 새로운 종류의 RNA로, 폐쇄 고리 모양의 구조를 가지고 있으며, 실제 핵 전사 그룹에 많이 존재한다.대부분의 환상 RNA는 외현자 서열로 구성되어 있으며, 서로 다른 종에서 보수성을 가지고 있으며, 조직 및 서로 다른 발육 단계의 표현 특이성이 동시에 존재한다.때문에환상 RNA핵산 효소에 민감하지 않기 때문에 선형 RNA보다 안정적이며, 이로 인해 환상 RNA는 새로운 진단 마커로서의 개발 응용에서 뚜렷한 우위를 점하게 된다.최근 연구에 따르면 환상 RNA는 서로 다른 종에서 miRNA 스펀지 역할을 하는데, 이를 경쟁성 내원 RNA (ceRNA) 라고 하며, 경쟁적으로 miRNA를 결합시킬 수 있다.그리고 질병과의 연관성 miRNA의 상호작용은 환상 RNA가 질병의 조절에 매우 중요한 역할을 한다는 것을 설명한다.

실험 작업 프로세스:

1. 샘플 RNA 추출

2. RNA 품질 검사

① 나노드롭을 사용하여 분광광도계 260nm, 280nm, 230nm에서 RNA의 흡수치를 측정하여 농도를 계산하고 순도를 평가한다.

② 포름알데히드 전기영역 시약으로 변성 글리세린 겔 전기영역을 진행하여 RNA의 순도 및 완전성을 측정한다.

③ RNA QC 보고서를 제공합니다.

3. RNase R 처리

4, cDNA/aRNA 샘플 합성 및 표시

5. 표기 효율 품질 검측은 Nanodrop을 사용하여 형광 표기 효율을 검측하고 표기 효율이 합격되어 후속 칩 실험 결과의 신뢰성을 확보한다.

6, 칩 교잡

표준 조건에서 표시된 프로브와 고밀도 게놈 칩을 교잡한다.

7. 이미지 수집과 데이터 분석

GenePix 4000B 코어 월 스캐너를 사용하여 칩의 형광 강도를 스캔하고 실험 결과를 디지털 데이터로 변환하여 저장하며 원본 데이터를 분석하고 연산하기 위해 부대 소프트웨어를 사용합니다.

8. 실험 보고서 제공

① Scanning Image: Cy3 형광 스캔 이미지;

② Scatter Plot: 산점 그래프, X축은 Control 신호 값, Y축은 Experiment 신호 값으로 신호 데이터의 전체 분포 추세를 나타냅니다.

③ Raw Data: 프로브의 스캔 형광 신호 강도 원시 데이터;

④ Normalized Data: 통계학적 방법을 표준화한 후 수치;

⑤ P-value: T-test는 현저한 차이 발현의 유전자를 통계적으로 분석하는데 p-value가 작을수록 이 circRNA는 두 샘플 간의 차이 발현이 현저하다

⑥ significant Up & Down Regulated CircRNA List: 현저한 차이 표현의 circRNA 목록에는 Fold Change, p-valuel 및 circRNA의 상세한 주석 정보(상응하는 선형 mRNA와 miRNA 결합 비트)가 포함되어 있습니다.

고객이 제공하는 기능:

1. 실험대상은 조직시료로서 적당량(50-100mg)의 신선한 조직시료 또는 정확하게 보존된 조직시료를 취하여 사용

BioPulverizer TM 동결 분쇄 조직, RNA 추출 시약 TRIzol (Invitrogen) 1m를 더하고 Mini-Bead-Beater-16 균일한 펄프를 사용한 후 RNA를 추출합니다.

2. 실험 대상은 세포 샘플이며, 각 샘플은 1x106~1x107 세포를 채취하고, 1m의 RNA 추출 시약 TRIzol (샘플은 밀착 세포, 10cm2 배양 접시당 TRIzo1 사용량은 1ml) 을 첨가하며, 분해 후 RNA를 추출한다.

제공 기준:

1. 칩 검측 데이터

2. 완전한 실험 조작 규정, 실험 보고서(소프트웨어 분석 결과 포함) 및 실험 재료

실험 대행 서비스: