이미지 분석의 미래 제시 - Amira-Avizo 2025.1 신규 버전 출시

사실적인 광선 효과와 선명한 돌출 요소로 복잡한 장면을 표현하는 것은 매우 도전적인 임무이다.전통적인 렌더링 방식은 종종 세부 사항을 납작하게 만들고 빛을 단조롭게 만들며 사람들이 데이터의 가장 중요한 부분에 집중하도록 유도하기 어렵습니다.Amira-Avizo는 최신 버전에서 새로운 3D 렌더링 설정을 제공하여 놀라운 비주얼과 풍부한 정보를 제공합니다.향상된 렌더링 기술, 더 넓고 정확한 광선 제어, 정확한 초점 도구를 도입하여 심도를 조정하고 정확한 초점 내용을 선택하여 특정 데이터 영역으로 주의를 끌 수 있습니다.

생명과학과 재료과학 분야의 연구자들은 끊임없이 더 높은 영상 해상도를 추구한다. 왜냐하면 많은 핵심 특징이 나노 척도에 존재하기 때문이다. 이 척도에서 미세한 차이는 기능, 성능, 신뢰성을 결정한다.더 선명한 이미지는 모호한 형태를 측정 가능하고 정량적인 데이터로 전환시켜 단백질 상호작용, 막 조직, 결정계 행위 및 결함 동태 배후의 메커니즘을 밝혀낼 수 있다.이미지 디테일이 증가함에 따라 이미지 분석도 그에 상응하여 개선되어야 한다.Amira-Avizo 소프트웨어는 최신 버전에서 2D 분할보다 안정적인 이미지 판독을 제공하여 구조의 연속성을 유지하기 위해 2.5D 분할을 구현했습니다.이러한 혁신적인 모델은 많은 이미지 리소스가 필요 없는 깊이 있는 3D 환경을 제공합니다.

이미지는 유낭체막의 3차원 구조를 보여준다.출처: EMPIAR database 11830 - doi.org/10.1101/2024.12.8.630444.

고품질의 분할과 3차원 재건을 실현하기 위해서는 과학자들이 주목하는 구조를 정확하게 표시해야 한다.수동 도구를 사용하여 치수를 지정하면 시간이 많이 걸리고 번거로울 수 있습니다.Amira-Avizo 소프트웨어의 최신 버전에는 마크업 속도를 높여 원본 데이터에서 결과로 더 빠르게 전환할 수 있는 새로운 인공 지능 보조 선택 도구가 도입되었습니다.

고정적이고 적응성이 없는 알고리즘을 사용하여 강력한 분할 모델을 구축하는 것은 매우 도전적입니다.정적 향상 방식은 내용을 가리지 않고 동일한 수의 이미지 트림을 생성하여 작업 프로세스가 경직되어 실험 진행을 늦추고 결과에 영향을 미칩니다.이 업데이트에서는 사용자가 정의한 관심 영역에 맞게 조정할 수 있는 동적 프로세스를 도입하여 최적의 수의 향상된 이미지 블록을 생성합니다.훈련 시간의 15% 만 사용해도 상당한 품질과 성능을 갖춘 모델을 훈련할 수 있어 시간을 대폭 절약할 수 있다.새로운 AI 기능은 일반적인 모델 관리 작업 수행, TensorBoard에서 훈련 과정 보기, 모델 평가, 각 관심 영역에서 예측 결과 시각화 및 분할 지표 보기 등을 구현했습니다.

이미지는 아미라-아비조 소프트웨어에서 코바이러스 입자가 암세포에 감염되는 3차원 구조를 시각화하는 동시에 새로운 AI 모델 관리자와 함께 구현할 수 있다.출처: EMPIAR database - 12270.

이제 Amira - Avizo 2025.1 릴리스에 보고서 작업공간을 통합하여 사용자 정의 보고서 템플릿을 엄격하게 제어하고 보고서를 효율적으로 자동 생성할 수 있습니다.이 새로운 작업공간을 사용하면 3D 결과를 보다 간편하게 신뢰할 수 있는 문서로 변환할 수 있어 보다 효율적이고 일관성 있는 프로세스를 수행할 수 있습니다.

그림은 보고서의 예를 보여 준다.

샘플은 자동차에 사용되는 복합 섬유의 일종이다.

새로운 기능은 클릭 한 번으로 제공되며 2025.1 버전과 호환됩니다.이 패키지는 기존 워크플로우를 새로 또는 대체할 수 있는 무료 업그레이드 패키지입니다.

• 인스턴스 분할 Xtra: Cellpose-SAM 방법으로 2D 이미지를 빠르고 고품질로 인스턴스 분할합니다.

• 분할된 데이터의 객체를 서로 다른 피쳐를 기반으로 분류하여 하위 카테고리를 식별합니다.

인스턴스 분할 확장 기능을 사용하여 배터리 입자에 대한 예제 전시 (왼쪽 사진)

도금 배터리에 대한 샘플 분할 전시 (오른쪽 사진) 도 있습니다.