나노홀 3세대 시퀀서 PromethION 2 Integrated

1. 제품 개요

나노홀 3세대 시퀀서 PromethION 2 Integrated(P2i)는 최대 2개의 PromethION 유속 유닛을 실행할 수 있도록 설계된 소형 데스크탑 장치입니다.각 흐름 유닛은 독립적으로 주소를 지정할 수 있으므로 실험을 동시에 또는 개별적으로 실행할 수 있습니다.P2i는 장치의 모든 데이터 수집 및 기본 주소 호출을 담당하는 엔터프라이즈급 컴퓨팅을 포함하는 독립형 제품입니다.또한 나노 구멍 시퀀싱 서비스를 제공할 수 있습니다.

나노홀 3세대 시퀀서 PromethION 2 Integrated흐름 셀을 삽입할 수 있는 두 개의 시퀀스 포트가 있습니다.이 장치는 작은 PromethION 2 Solo와 동일한 기능을 갖추고 있지만 *의 컴퓨팅 기능을 추가하고 NVIDIA Ampere GPU를 내장하여 두 PromethION 스트림 유닛의 데이터 기반 호출을 실시간으로 호출할 수 있습니다.현재 화학 및 소프트웨어는 단일 PromethION 흐름 유닛에서 최대 290Gbases*의 데이터 생성을 지원합니다(* 이론적 출력 Max는 72시간 동안 420 염기/초 시퀀싱을 기반으로 함).

2. 핵심 기술

Oxford Nanopore 시퀀싱은 나노 구멍 단일 분자 검출 기술을 기반으로 합니다.서열을 측정할 때 핵산분자 (DNA/RNA) 는 모터효소의 구동하에 단사슬형식으로 하나하나의 염기가 나노구멍을 통과한다.염기가 통과하면 나노 구멍 내의 전류 강도가 바뀌며 염기 (A, T, C, G) 및 수식 염기에 대응하는 전류 신호에 따라 차이가 있습니다.장치는 MinKNOW를 통해 이러한 전류 변화를 실시간으로 포착합니다.™등 소프트웨어가 염기서렬로 전환되여 단분자의 직접적인 서렬측정을 실현한다.이 기술은 PCR 증폭 없이 염기 손질 정보를 보존할 수 있으며 읽기 길이가 제한되지 않아 실시간 데이터 분석을 실현할 수 있어 휴대성과 효율성을 겸비한다.

3. 핵심 성능 우위

통합형 데스크탑 디자인:완전 자체 포함식 데스크탑 설비 형태를 채택하고, 완전한 계산 모듈을 내장하며, 추가 외부 컴퓨터나 서버가 필요 없고, 설비 배치 절차를 대폭 간소화하며, 실험실 공간을 절약하고, 각종 과학 연구와 임상 장면에 적합하다.

강력한 계산력 + 직관적인 조작, 뛰어난 효율:고성능 GPU를 탑재하여 실시간 염기 인식, 게놈 조립 등 복잡한 분석 임무에 충분한 계산력 지원을 제공한다;내장 스크린을 갖추고 있어 서열 분석 진도, 전류 신호 등 핵심 정보를 직접 볼 수 있어 조작 상호작용이 더욱 편리하다.

듀얼 Flow Cell 병렬, 유연성 및 적합성:최대 2개의 PromethION Flow Cell을 동시에 실행할 수 있도록 지원하며, 실험 수요에 따라 단일 채널 독립 시퀀싱 또는 이중 채널 동시 부팅을 선택할 수 있어 소량 샘플의 빠른 검측을 만족시킬 수 있을 뿐만 아니라 중고 통량 시퀀싱 임무에도 대응할 수 있어 자원 활용이 더욱 유연하다.

사전 구성 플러그 앤 플레이, 낮은 문턱:장비 출하 시 시스템 사전 구성이 완료되어 복잡한 매개변수 디버깅 없이 전원을 연결하면 시퀀싱 프로세스를 시작할 수 있으며, 전문 기술자가 아니더라도 신속하게 시작할 수 있어 운영 및 유지 관리 비용을 크게 줄일 수 있습니다.

고성능 스토리지 및 컴퓨팅 지원:16TB 대용량 SSD를 장착하여 대용량 시퀀싱 데이터를 로컬로 저장할 수 있으며 외부 저장 장치에 의존할 필요가 없습니다.64GB의 고대역폭 RAM은 데이터 읽기 및 쓰기 및 분석 프로세스의 원활한 작동을 보장하며 *의 NVIDIA A-Series GPU와 함께 복잡한 실시간 염기 인식, 게놈 조립 및 변이 분석에 강력한 계산력을 제공하여 데이터 분석 시간을 대폭 단축합니다.

HD 상호 작용과 유연성:고해상도 터치스크린을 탑재하여 서열 분석 진도, 전류 신호, 데이터 분석 결과 등 핵심 정보를 선명하게 표시할 수 있으며 조작 인터렉션이 더욱 직관적이고 정확하다;동시에 기존 컴퓨터 인프라의 도킹을 지원하여 로컬 터치스크린을 통해 편리하게 조작할 수 있을 뿐만 아니라 실험실의 기존 시스템에도 융합할 수 있어 서로 다른 사용 습관과 작업 흐름에 유연하게 적합하다.

4. 응용분야

전체 게놈 연구: 단일 채널 8Tb 데이터는 인간 전체 게놈 30 × 이상 깊이 시퀀싱을 실현할 수 있으며, 긴 읽기 긴 조력 T2T (끝에서 끝까지) 완전한 게놈 조립, 복잡한 구조 변이 해석;

매크로 게놈 심층 분석: 토양, 해양 등 복잡한 환경 샘플을 지원하는 매크로 게놈 심도 서열 분석을 많이 생산하여 저풍도 (<0.1%) 미생물을 검출하고 기능 유전자를 정확하게 주석할 수 있다;

임상 대규모 검사: 이중 통로를 병행하면 수백 개의 임상 샘플 (예: 바이러스 전체 게놈 서열 분석) 을 동시에 처리할 수 있으며, 실시간 데이터 분석은 신속한 분형과 변이 모니터링을 돕고, 공중보건 응급 대응을 지탱한다;

동식물 육종 연구: 대형 동식물 게놈 (예: 밀, 소 게놈) 에 높은 양의 긴 읽기 데이터를 제공하고, 분자 표기 개발과 유전 도감 구축을 보조한다.

5. 설비 규격

* 전자 장치 기능 범위 +5ºC ~ +40ºC

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