나노 구멍 시퀀싱 라이브러리 제조 시스템 - Samplix 단세포 분석

고화질 유전자 문고 제조기

나노 구멍 시퀀싱 라이브러리 제조 시스템 - Samplix 단세포 분석: 일종의 고전통량 단세포, 단분자, 나노입자 유화액적 봉인 및 선별 시스템

웨이 이단분자, 세포, 세포기, 나노입자 패키지와 높은 처리량 선별을 실현할 수 있다.DNA 패키지는 qian suo wei you의 속도로 크고 복잡한 유전자 라이브러리를 선별 할 수 있습니다.

Xdrop은제조형

나노 구멍 시퀀싱 라이브러리 제조 시스템 - Samplix 단세포 분석고해상도 다운스트림 분석을 위해 살아있는 포유류 또는 미생물 세포, 세포기, DNA 또는 기타 생물학적 재료를 제조하는 다기능 사용자 친화적 인 장비입니다.

우리의 Xdrop 시약 상자를 사용하여 Xdrop은 안전하고 빠르게 살아있는 세포, 세포기 또는 DNA 조각을 측정 화학 물질과 함께 고도로 안정적인 피승체적 이중 유화 액체에 봉인합니다.이 액적들은 이액, 와선, 부화, 유식세포술, 선별, 심지어 장기 저장을 통해 안정적이다.무엇보다 액체에서 세포를 회수해 증폭할 수 있다.

적절한 분석 기술과 함께 Xdrop 애플리케이션은 다음과 같습니다.

1 인체면역세포, NK세포

2 미생물 세포의 효소 분비

3 포유동물 세포 분비 세포인자

4 예기치 않은 표적 및 탈표적 재배치 평가를 포함한 유전자 편집 검증

Xdrop을 사용하면 연구자들은 인간, 동물, 식물 및 미생물의 세포 기능 및 게놈학을 더 쉽게 이해할 수 있습니다.Xdrop은 또한 편차 없는 전체 게놈 증폭을 위해 DNA를 패키지하는 것을 포함하여 다른 워크플로우에 단일 로션 액체를 생성할 수 있습니다.Xdrop에 필요한 전체 키트, 키트 및 액세서리를 제공합니다.또한 사용자 교육은 표준 Xdrop 설치 서비스의 일부입니다.

우위

1 Xdrop은 살아있는 포유류 또는 미생물 세포를 고도로 안정된 이중 유액 방울에 싸서 기능 측정, 부화, 표형 분석 및 선별에 사용할 수 있습니다.

2 Xdrop은 공학 세포 및 유전자 치료 연구에서 중요한 질문에 답하는 데 도움이됩니다.

3 Xdrop은 효소 진화 및 경로 공정을 포함한 분자 공학 워크플로우를 지원합니다.

4 Xdrop은 사용자 친화적인 인터페이스와 작은 설치 공간을 통해 각 분자 생물학 연구소에서 미세 유체의 * 기능을 사용할 수 있습니다.

이중 유화 시약함

모든 시약은 시약함에 포함되며 매번 조작할 때마다 수백만개의 세포나 분자를 포장할수 있다.

Xdrop 정렬제조 분할 선택

이 Xdrop 패밀리의 새로운 구성원은 형광 기반 세포 분할 경험이 필요 없는 사용자 친화적 인 워크플로우에서 이중 로션 액체를 생성하고 분할 할 수 있습니다.

작업과정은 고도로 안정된 액체에서 100kb DNA 조각, 소단세포 또는 기타 생체재료를 포획하는 것으로 시작해 PCR과 효소 활성평가 등 측정에 활용된다.그런 다음 액체 방울에 포함된 형광에 따라 관심 있는 샘플만 획득하여 고해상도 다운스트림 분석을 수행하기 위해 액체를 선별합니다. 예를 들면:

실수로 재배열된 PCR 편차를 숨기지 않은 CRISPR 편집 확인

바이러스 및 유전자 변형 통합 위치 식별

단세포 수준에서 효소의 활성을 평가하다

대용량 GFP 필터링 수행

이점:

· 목적성 있게 긴 부분을 풍부하게 모을 수 있다

· 고감도 - 단분자 검출

· DNA의 내재성을 유지한다

· 선험 시퀀스 지식이 거의 필요 없음

· PacBio, Nanopore 및 Illumina 시퀀싱 호환

· 자동 마이크로 유체 시스템으로 쉽게 설정

· 회전 시간을 몇 주에서 며칠로 단축

적용:

· 구조변화

· 복잡한 샘플 (예: 암 생검)

· 시퀀싱하기 어려운 영역(예: GC 포함)

· 게놈 클리어런스 폐쇄

·유전자정상/유전자분형/단배체분형

· 항성 유전자를 숙주와 연결

· 저풍도 영역의 서열 분석

· 반복 영역의 평가

· 나크 DNA만 함유된 샘플

보조재료

1, DE50 카트리지 - 포유류 세포를 두 유액 방울에 싸는 데 사용

고도로 안정된 ~100피리터 쌍유액방울을 생성하여 포유동물세포를 포장하고 대세포를 단세포검사로 전환시킨다.Xdrop DE50 Cartridge를 사용하는 작업 흐름에는 세포 인자 분비 및 세포 살상 측정이 포함됩니다.시약과 샘플을 로드하고 Xdrop에 키트를 넣은 다음 프로그램을 실행하기만 하면 됩니다.

8개 샘플을 동시에 또는 개별적으로 실행

8분 동안 각 레인에서 최대 500000개의 액체 방울이 CO 2 배양 상자에서 세포로 액체 방울을 부화시킨다

확장을 위해 선택한 셀 복원

2. DE20 카트리지 - 미생물 세포, 세포기 또는 DNA의 긴 조각을 두 유액 방울에 싸는 데 사용

독립된 Xdrop DE20 작은 기둥을 사용하여 수백만 개의 미생물 세포, 세포기 또는 DNA를 캡슐화하기 위해 고도로 안정적인 약 1.5 피리터의 이중 유화 액체를 생성합니다.각 액체방울은 단세포 해상도 측정이나 DNA 표적이 풍부한 격실 역할을 한다.시약과 샘플을 로드하고 Xdrop 또는 Xdrop Sort에 키트를 넣은 다음 프로그램을 실행하기만 하면 됩니다.

8개 샘플을 동시에 또는 개별적으로 실행

45분 동안 레인당 최대 1000만 개의 액체 방울이 CO 2 배양함에 세포로 부화된다

선택한 셀을 복원하여 오염되지 않은 워크플로우를 위한 확장

3. DE20 분선함 - DNA 또는 소세포가 함유된 이중 유액 방울을 분선하는 데 사용

신형 Xdrop DE20 선별함을 사용하여 형광 DNA나 소세포가 함유된 이중 유화 액체를 선별한다.이 사용자 친화적 인 시스템은 우리의 새로운 기기 인 Xdrop Sort와 함께 사용하기 위해 설계되었으며 형광 선별기에 대한 전문 지식이 필요하지 않습니다.시약과 샘플을 로드하고 Xdrop Sort에 키트를 넣은 다음 선별 프로그램을 실행하기만 하면 됩니다.

최대 8개의 샘플을 동시에 실행하여 매일 수십억 개의 액체를 분류하여 오염되지 않은 작업 과정을 확보한다

4, SE85 카트리지 - DNA, RNA, 세포기 또는 소세포를 단유액 액체에 싸는 데 사용

개별 Xdrop SE85 카트리지를 사용하여 수백만 개의 분자, 세포 기관 또는 세포를 캡슐화하기 위해 단일 로션 액체 방울을 생성합니다.각 액체방울은 단분자나 단세포 해상도 측정의 격실 역할을 한다.시약과 샘플을 로드하고 Xdrop 또는 Xdrop Sort에 키트를 넣은 다음 프로그램을 실행하기만 하면 됩니다.

8개 샘플을 동시에 또는 개별적으로 실행

40초 이내에 레인당 50000개 이상의 액체 방울을 생성하여 오염되지 않은 워크플로우 보장

앱

Xdrop은 생물 재료를 포장하는 데 사용되는 고도로 안정적인 이중 유화 액체와 단일 유화 액체를 생성하는 독점 마이크로 유체 기술을 사용합니다.

이 다기능 사용자 친화적 인 기기는 살아있는 포유류 및 미생물 세포 또는 DNA 긴 조각과 같은 생명의 구성 요소를 패키지하여 부화, 분석, 분류 및 분자 스펙트럼 분석을 포함한 일련의 하류 목적에 사용됩니다.

Xdrop Sort는 Xdrop 독점 마이크로 유체 기술을 기반으로 패키징 바이오 소재에 기반한 형광 선별 이중 유액 방울의 능력을 증가시킵니다.

다음은 대표적인 애플리케이션입니다.

세포 기능 분석:

· 인체면역세포, NK세포

· 미생물 세포의 효소 분비

· 포유동물 세포 분비 세포인자

게놈학 응용:

· 구조변화

· 복잡한 샘플 (예: 암 생검)

· 시퀀싱하기 어려운 영역(예: GC 포함)

· 게놈 클리어런스 폐쇄

·유전자정상/유전자분형/단배체분형

· 항성 유전자를 숙주와 연결

· 저풍도 영역의 서열 분석

· 반복 영역의 평가

· 나크 DNA만 함유된 샘플

식물 게놈학 응용:

· 식물 품종 중 특정 게놈 구역을 풍부하게 하였다

· 게놈을 참고하지 않은 보리 품종 중 생물합성 유전자 클러스터의 구조를 밝혀내다

· 토마토 품종 중 생물합성 유전자 클러스터 구조의 공백 메우기

인스턴스 적용:

1, 전체 게놈의 정확한 증폭

사실상 99% 의 표적게놈은 한차례도 문고의 서렬분석에 의해 덮여있는것이 아니다.

Xdrop dMDA 기술을 사용하여 유전자를 증폭하면 입력량이 1pg로 낮을 때도 모든 유전자를 정확하게 증폭시킬 수 있다.

2. 유전자 정상 Phasing

CYP2D6*7 등위 유전자에는 단일 뉴클레오티드 다태성(SNP)이 1개씩 포함되지만, CYP2D6*25A에는 22개의 SNP가 들어 있다.

Xdrop 기술은 Phasing을 포함한 23가지 모든 변형을 정확하게 측정할 수 있습니다(아래 그림 참조).

Xdrop은 간단한 디자인과 긴 DNA 조각 (~100 kb) 의 간접 시퀀스 캡처를 통해 응용 프로그램을 지원합니다.긴 읽기 긴 서열 분석과 결합하여 Xdrop은 단일 유전 이질 샘플에서 유전자의 위상을 결정하는 어려움을 극복했습니다.

풍부한 고화질은 등위 유전자 중 하나 이상의 SNP를 검출하고 처음부터 조립하면 구조 변화를 해결할 수 있다.

3. 유전자의 복잡한 구조 변화를 모니터링한다

브레이크 간 판독에 대한 상세한 분석에 따르면 8번 염색체의 영역에 여러 개의 HPV18 통합 비트가 존재한다.PacBio, Oxford Nanopore 및 Illumina 데이터 세트는 인식된 통합 비트를 지원합니다.

Xdrop 기술은 새로운 표적 DNA 리치 방법으로, 그 unique는 천연 DNA 조각을 선택, 리치 및 시퀀싱할 수 있다는 데 있습니다.이렇게 하면 알 수 없는 영역을 포함하여 큰 게놈 부분 (약 100kb) 을 수집할 수 있습니다.Xdrop 사용?메서드가 생성하는 긴 조각은 긴 읽기 시퀀스에 적용될 뿐만 아니라 짧은 읽기 시퀀스에 가치 있는 컨텍스트 정보를 제공할 수 있습니다.

4, 알 수 없는 관심 영역(ROI)에 대한 시퀀싱

PCR 및 프로브 기반 표적 DNA 리치 메소드는 집중적인 설계 최적화와 완전한 관심 영역(ROI) 지식이 필요합니다.이러한 전통적인 접근 방식은 반복 영역, 구조적 변이, GC가 풍부한 영역과 같은 복잡한 게놈 환경과 알려지지 않고 재배열된 영역을 나타내는 데도 실패했습니다.이러한 한계를 극복하기 위해 Samplix는 간접 시퀀스 캡처 기반의 Xdrop 리치 워크플로우 인 새로운 마이크로 유체 방법을 개발했습니다.

Xdrop은 ROI의 작은 부분이나 측면 영역에 대응하여 검사 시퀀스에 단일 유인물 쌍을 설계해야하는 긴 (~100 kb) 표적 DNA 영역을 풍부하게 만들 수 있습니다.이 증폭 서브는 전체 길이 ROI를 테스트, 선택 및 리치화하여 캡처하고 시퀀싱하는 데 특별히 사용됩니다.

Xdrop 사용?이러한 도전적 영역을 해결하는 기술의 능력은 많은 수의 게놈을 나타내는 다른 도전적 영역을 해결하는 문을 엽니다.Xdrop 리치를 장독 및 단독 시퀀싱 기술과 결합하면 전체 게놈 시퀀싱을 우회하여 복잡한 게놈 장면을 빠르고 경제적으로 해결하는 데 필요한 고해상도를 제공할 수 있습니다.

5. CRISPR 유전자 편집 조작 식별 및 확인

Xdrop은 간단한 설계와 긴 DNA 조각의 간접 시퀀스 캡처를 통해 일반적으로 찾기 어렵고 비용이 많이 드는 유전자 변형 삽입 비트를 식별하는 데 도움이됩니다.

구축체의 무작위 통합과 숙주 게놈 서열의 존재는 통합 비트 감정을 복잡하게 한다.Xdrop은 게놈 엔지니어링을 간단명료하게 검증합니다.

실험 과정

1. 혼합 dPCR 시약

대상 특이성 pri-mers가 포함된 dPCR 반응 혼합물에 DNA를 추가합니다.

2. 편상 액적 생산

반응은 수포수액 (DE) 액적을 생산하기 위해 액적 발생기 칩에 분배됩니다.

3. 고해상도 미적식 중합효소 체인 반응

액체방울은 열순환을 거쳐 수백만 개의 PCR-re 작업을 병행할 수 있다.형광 액체 방울을 검사함으로써 목표 DNA 분자를 가진 액체를 식별할 수 있다.

4, 계수 및 분리 액체 방울

검사 및 분리는 표적 DNA 분자가 함유된 PCR 양성 액체를 수집 할 수있는 세포 선별 장비 (FACS) 를 사용하여 완료되었습니다.

5. 풍부한 DNA의 증폭

긴 DNA 조각의 풍부한 단일 분자는 편향 없는 DNA 증폭과 대상 영역에 대한 균일한 커버리지를 보장하기 위해 액적 다변위 증폭 (dMDA) 을 통해 증폭됩니다.

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