널리 사용되는 Cell Painting 분석과 같은 이미지 기반 표형 분석 방법은 고내포 이미징 및 다중 파라미터 송출을 사용하여 세포의 생물, 유전 및 화학 교란을 연구합니다.이런 날로 유행하는 방법은 약물 발견 프로젝트에서 게놈 선별 연구에 이르기까지 응용되고 있다.표준 Cell Painting 실험에서는 다양한 세포기와 구조(세포핵, 세포질, 미토콘드리아, 고르기체, 내질망, 세포골격, 포질RNA, 핵인)가 5개의 이미징 채널에서 채집됐다.이런 광범위한 세포염색은 단세포해상도로 여러가지 형태의 교란을 감시하고 정량할수 있다.발표된 Cell Painting 분석의 한계에는 적합한 염료의 가용성이 좁고 이미징 시스템이 충분한 스펙트럼 분리 능력을 제공하는 것이 포함됩니다.구체적으로 볼 때 고리기체와 근동단백질은 같은 통로를 통해 영상화되였는데 이는 영상분석에서 이 두가지 구조를 구분하는데 도전을 가져다주었다.이러한 제한은 hit의 선택을 방해하거나 특정 화합물의 효과를 은폐 할 수 있습니다, 특히 고르기체 (생물 합성 경로) 또는 세포 뼈대 네트워크에 영향을 미치는 작용 메커니즘 (MOA) 을 가진 화합물.