고내포표형분석은 갈수록 많은 연구분야에 널리 응용되고있는데 여기에는 유전자기능연구, 약물연구개발과 독리학이 포함된다.이 방법의 장점은 매우 객관적으로 단일 세분화된 수준에서 다차원적인 정보를 획득하여 단일 세포의 상태를 분석하고 묘사하며 전체 분석 데이터와 비교할 수 있다는 것이다.그러나 많은 전통적인 표형 분석은 연구하고자 하는 통로에서 소수의 중요한 지표만 주관적으로 선택하여 분석하는 것이다1. 따라서 전통적인 표형 분석에서 대부분의 실험 처리로 인한 생물 관련 변화는 쉽게 무시된다.
한 세포의 표형 분석은 세포 상태를 나타내는 수천 개의 계량화 가능한 지표로 이루어져 있다.이러한 지표는 생물 표지물의 표현, 구조와 분포에서 추출한 정보를 포함한다.일반적으로 이러한 표시는 세포기가 특이적으로 식별하고 그 구조, 공간적으로 기타 아세포구조와의 관계에 관한 정보를 제공한다.이러한 세포의 분류 정보는 화합물, 소분자 물질 또는 유전자 교란을 연구 할 때 고객의 효과적인 분석 근거를 제공 할 수 있습니다.비슷한 작용 메커니즘을 가진 화합물 (MOA) 은 종종 비슷한 세포 형태 변화를 일으킨다.따라서 표형 스펙트럼 간의 비교는 새로운 화합물의 MOA에 근거를 제공할 수 있다3마찬가지로, 동일한 경로의 유전적 간섭은 종종 유사한 표형 스펙트럼을 초래하는데, 이는 표형 스펙트럼이 높은 통량 기능 게놈학 연구에 사용될 수 있다는 것을 설명한다7。