크로마토그래피 기둥의 분리 효과는 선택한 고정상과 크로마토그래피 기둥의 제조 및 조작 조건에 따라 달라집니다.크로마토그래피는 분리 분석 수단으로 분리가 핵심이기 때문에 분리 작용을 하는 크로마토그래피 기둥은 크로마토그래피 시스템의 심장이다.

크로마토그래피 기둥은 기둥 파이프, 압모, 카드 커버(밀봉 고리), 체판(필터), 이음매, 나사 등으로 구성된다.기둥관은 대부분 스테인리스강으로 만들어져 압력이 70kg/cm2보다 높지 않을 때도 두꺼운 벽유리나 석영관을 사용할수 있으며 관내벽은 아주 높은 광결도를 요구한다.

기둥의 효과를 높이고 관벽의 효과를 줄이기 위하여 스테인리스강 기둥의 내벽은 대부분 광택을 낸다.스테인리스 기둥 내벽에 불소 플라스틱을 발라 내벽의 광택을 높이는 사람도 있는데, 그 효과는 광택과 같다.

실리콘이나 유리 라이닝을 녹여 가는 파이프 기둥에 사용하는 것도 있다.크로마토그래피 기둥 양쪽 끝의 기둥 이음매에는 체판이 장착되어 있으며, 스테인리스강이나 티타늄 합금을 소결하는 것으로 공경 0.2~20μm(5~10&μm)으로 충전재의 입도에 따라 충전재의 누출을 방지하기 위한 것이다.

크로마토그래피 기둥은 용도에 따라 분석형과 제조형 두 종류로 나눌 수 있으며 사이즈 규격도 다르다.

1. 일반 분석 기둥(상량 기둥), 내경 2~5mm(상용 4.6mm, 국내 4mm와 5mm), 기둥 길이 10~30cm;

2. 좁은 지름 기둥 (narrow bore, 일명 세관 지름 기둥, 반미세 기둥 semi-microcolumn), 내경 1~2mm, 기둥 길이 10~20cm;

3. 모세관 기둥 (일명 마이크로 기둥 microcolumn), 내경 0.2~0.5mm;

4, 반제조기둥, 내경>5mm;

5. 실험실 제조 기둥, 내경 20~40mm, 기둥 길이 10~30cm;

6. 생산제조기둥의 내경은 몇십센치메터에 달한다.기둥의 내경은 일반적으로 기둥의 길이, 충전재의 입경과 접합류속에 근거하여 확정하는데 그 목적은 관벽효과를 피하기 위해서이다.