대량의 복잡한 기체의 샘플에 대해 이온 크로마토그래피는 적합한 방법을 채택하여 예처리를 거친 후 다시 이온 크로마토그래피로 분석할 수 있다. 이렇게 하면 한편으로는 샘플의 복잡한 기체가 이온 크로마토그래피 기둥에 대한 오염을 해결할 수 있고, 다른 한편으로는 복잡한 기체 샘플의 측정 결과와 정확성을 크게 높일 수 있으며, 분석 방법의 민감도를 높일 수 있다.